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Material suplementario del artículo "Análisis de susceptibilidad a mutaciones que confieren resistencia a inhibidores de las enzimas proteasa principal (Mpro) y ARN polimerasa ARN-dependiente (RdRp) del SARS-CoV-2"

Clinical Data Table containing all relevant information for the COVID-19 study performed, in particular COVID-19 disease duration (which was used to stratify the lung samples analyzed by multiplexed histology and spatial transcriptomics) and presence of SARS-CoV-2 viral particles.

O SARS-COV-2 rapidamente configurou uma Emergência Sanitária Internacional ocasionado em milhões de casos em todo o mundo, com milhares de mortos e inúmeros sobreviventes. Torna-se relevante concentrar esforços com o intuito de entender os aspectos envolvidos e já relatados por outras investigações abordando sequelas do Pós-covid 19, visto que inúmeros estudos ainda estão sendo desenvolvidos abordando esta temática. Neste contexto, tem crescido a preocupação das repercussões deste agravo no Sistema Nervoso Central o número crescente de casos e mortes causados pelo SARSCOV-2 durante o período pandêmico e periférico. As revisões rápidas têm como estratégias o intuito de garantir a disponibilização de evidências cientificas de qualidade aos tomadores de decisão. Nesta perspectiva, tal protocolo visa identificar as principais sequelas neurológicas do Pós-Covid 19, citadas em trabalhos de revisões sistemáticas produzidas em idiomas português, inglês e espanhol, nos anos de 2020 a 2022.

The project organized four multi-disciplinary training courses covering all steps in the enforcement chain (including inspection and detection, investigation, prosecution and sentencing). The trainings aimed to enhance national and international cooperation, and involve awareness raising webinar sessions to reach a global audience of practitioners. The training were originally meant to be organized in Germany, the Netherlands, Slovakia and Ireland, but due to the COVID-19 pandemic three were converted into online workshops, (Germany, Slovakia and Ireland), while the one in the Netherlands was conducted face-to-face. The sessions were designed upon the project outcomes and findings of the Training Needs Assessment and leveraged on the Training Toolkit developed within the project. The four online trainings were organized and successfully delivered to more than 350 participants throughout 2021 and 2022.

Protocolo de revisão rápida sobre intervenções para aumentar a adesão à vacina pediátrica COVID- 19 no Brasil. Elaborado como parte das atividades do Trabalho de Conclusão de Curso da Pós-Graduação Lato Sensu Vigilância e Cuidado em Saúde no Enfrentamento da Covid-19 e de Outras Doenças Virais – VigiEpidemia, ofertado pela Fiocruz Mato Grosso Do Sul. Equipe elaboradora: Narlene Fontenelle Basílio da Silva (discente), Marcela Leite Macedo (discente) e Tatiana Yonekura (tutora).

These codebooks were developed as part of a study titled "Academic explanatory journalism and emerging COVID-19 science: How social media accounts amplify The Conversation’s preprint coverage" (published in Media International Australia with co-authors Axel Bruns and Jean Burgess). They can be used to analyze the nature of publicly available Twitter and Facebook accounts in terms of the type of account (e.g., individual, group, etc) and the type of actor group (e.g., academia, healthcare, political actor, etc).

Supporting information for "Adaptive strategies for the deployment of rapid diagnostic tests for COVID-19: a modelling study"

El preprint describe un estudio que analiza la calidad de sueño en una muestra de estudiantes de medicina en una institución de Cuba. El manuscrito reporta que una mayoría de los estudiantes sufren trastornos en la calidad del sueño sufridos, y que estos se asocian con ansiedad, trastornos psicológicos y una autopercepción de rendimiento académico medio-bajo. Incluyo debajo unas cuantas cuestiones y sugerencias: Introducción: Las referencias citadas respecto a calidad de sueño en estudiantes de otras carreras son estudios en los Estados Unidos, hay otros estudios en otras regiones (particularmente en Iberoamérica), ya que las exigencias de estudios de medicina y otros estudios superiores pueden variar de un país a otro. Introducción: Sería relevante señalar las lagunas de evidencia que se abordan con este estudio. Material y métodos: La muestra de 37 estudiantes es limitada, ¿se completó un cálculo del tamaño de la muestra antes del estudio para establecer una muestra mínima requerida para el análisis estadístico?¿Hay alguna información sobre si la muestra es representativa de la población de esta universidad o de los estudiantes universitarios del país? Material y métodos: La encuesta se realizó entre noviembre 2020 y febrero 2021, sería relevante incluir el motivo para utilizar este período de tiempo. Material y métodos: Por favor ¿se podría añadir referencia para el 'test de Pittsburg' utilizado, ha sido este traducido y adaptado al español? ¿Qué versión se utilizó? Añadir por favor también una referencia para el 'test de Hospital de ansiedad-depresión'. Material y métodos: Hay mención a consentimiento informado, sería relevante aclarar aclarar también si se buscó la aprobación ética para el estudio. Material y métodos: El cuestionario incluye el punto 'Diagnóstico de COVID-19', se puede añadir clarificación sobre la información que se colectó con este punto? Esto, es si se refiere a un diagnóstico de COVID-19 actual (en el momento de responder el cuestionario) o previo? Los resultados sobre rendimiento académico están basados en la percepción de los participantes y no tenemos referencia de cómo hubiese sido la respuesta antes de la pandemia. Dado esto, no estoy segura de que se pueda establecer un vínculo con la pandemia, la calidad del sueño o los problemas de salud mental, recomiendo ajustar el texto para aclarar este punto. El estudio es observacional y de corte transversal, por lo tanto no puede establecer un vínculo de causa-efecto, sólo una asociación. Se recomienda revisar el texto (en la introducción y la discusión) para asegurarse de que solo se describen asociaciones. Fortalecería la discusión del estudio si se puede añadir una breve discusión acerca de próximos pasos o posibles intervenciones sugeridas a partir de los resultados de este estudio.

COVID-19 is a new public health crisis caused by the novel respiratory pathogen SARS-CoV-2. It is one of the most significant pandemic events in recent history. The SARS-CoV-2 Beta corona virus was transmitted to humans in the end of 2019 by unknown intermediary host from bats in Wuhan, Hubei province (China). It marked the third major coronavirus source of disaster in the 21stcentury.The three last severe respiratory tract infections caused by the SARS-CoV-1, MERS-CoV and SARS-CoV-2 caused high human mortality. Viral genomic sequencing and investigations and the development of advanced vaccine strategies are expected to give us more information on these emerging pathogens and controlling them in the future. The aim of this review is to summarize updated information regarding these emerging human coronaviruses to understand their molecular and structural biology, transmissions and potential vaccine approaches actually developed against the SARS-CoV-2.

Supplementary Video 1 Detection of SARS-CoV-2 E mRNA (with mixed ATTO550-labeled probes BME001 and BME002; red) at 12 h after co-transfection with SARS-CoV-2 E and N plasmids. The video was generated by volume rendering of a Z-Stack. Optical slice interval: 0.50 µm; Stack size: 6.0 µm. Objective lens: 60×. Supplementary Video 2 Detection of SARS-CoV-2 N mRNA (with mixed ATTO488-labeled probes BMN001 and BMN002; green) at 12 h after co-transfection with SARS-CoV-2 E and N plasmids. The video was generated by volume rendering of a Z-Stack. Optical slice interval: 0.50 µm; Stack size: 6.0 µm. Objective lens: 60×. Supplementary Video 3 Co-detection of SARS-CoV-2 E mRNA (with mixed ATTO550-labeled probes BME001 and BME002; red) and SARS-CoV-2 N mRNA (with mixed ATTO488-labeled probes BMN001 and BMN002; green) at 12 h after co-transfection with SARS-CoV-2 E and N plasmids. The video was generated by volume rendering of a Z-Stack. Optical slice interval: 0.50 µm; Stack size: 6.0 µm. Objective lens: 60×.