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International audience; Introduction. Les médecins, premières personnes exposées et victimes des épidémies, sont au cœur des dispositifs de riposte à l’épidémie de Covid-19. Au printemps 2020, au cœur de la première vague épidémique, il est apparu essentiel de pouvoir documenter les connaissances, attitudes et pratiques (CAP) de ces maillons essentiels de la lutte contre la Covid-19 au Burkina Faso. Leur compréhension de la maladie, l’impact de la maladie sur leurs pratiques professionnelles, leur accès au matériel de protection, etc. sont autant d’aspects qui peuvent impacter directement la santé publique, nécessitant des prises de mesures par les autorités nationales. L’objectif principal de cette étude était de fournir aux acteurs nationaux impliqués dans la gestion de la crise des données probantes régulières et représentatives à l’échelle nationale sur les connaissances, attitudes et pratiques des médecins au Burkina Faso.Méthode. L’enquête CAP-CoV-BF a pu être financée dans le cadre du programme Aphro-CoV financé par l’Agence Française le Développement et mis en œuvre par le consortium REACTing. Le protocole de l’enquête a été développé en mai et juin 2020 et soumis au Comité d’Éthique pour la recherche en santé du Burkina Faso en juin 2020. L’enquête a été approuvée fin août. L’enquête CAP-CoV-BF est une série de trois vagues d’enquêtes quantitatives transversales (échantillons indépendants) par téléphone réalisée auprès d’un échantillon représentatif d’environ 200 médecins sur l’ensemble du territoire burkinabè. Les trois vagues ont été réalisées à différents stades de l’épidémie burkinabé : (i) alors que le nombre de cas était relativement peu important et plutôt stable en septembre 2020 ; (ii) début décembre 2020 alors que le pays faisait face au début d’un nouveau pic épidémique ; (iii) fin février 2021 à la fin de la vague épidémique ayant démarré en décembre 2020. La base d’échantillonnage était l’annuaire de l’ordre national des médecins du Burkina Faso (3548 médecins enregistrés). Résultats. Avant chaque vague d’enquête, 750 médecins étaient tirés au sort et recevaient un SMS de préannonce de l’enquête. Ils avaient la possibilité à cette étape de répondre au SMS pour refuser d’être appelé (vague 1 : 0 refus, vague 2 : 7, vague 3 : 9). L’envoi du SMS permettait également de vérifier si les numéros étaient toujours valides. Parmi les numéros valides et sans refus, un second échantillonnage était effectué. Chaque numéro de téléphone mis en production était rappelé au moins 5 fois (5 jours à des horaires différents) avant d’être considéré comme injoignable. Les refus de participer après décrochage sont restés relativement limités (respectivement 23, 5 et 10). Au final, 166 questionnaires ont été complété en 15 jours de collecte lors de la première enquête, 190 questionnaires en 13 jours pour la seconde et 203 questionnaires en 13 jours pour la troisième. Conclusion. Le dispositif d’enquête a permis de réaliser en des temps courts et avec un budget limité une enquête nationale et représentative des médecins au Burkina Faso. La passation par téléphone a permis à la fois de couvrir l’ensemble du territoire national tout en respectant les procédures de distanciations en vigueur.

International audience; This article aims to assess the sustainability of the Fruit and Vegetable Supply Chain (SCF &V ) of the city of Meknes in Morocco in the context of the Covid-19 health crisis. During this crisis, new and more sustainable food supply practices emerged (mutualized and proximity supply, reduction of food waste…) and thus made the CAF & L evolve towards a sustainability process. Our method was based on the calculation of the performance of 12 indicators composing 5 dimensions of sustainability (the territorial, economic, social, ecological and food security dimensions). The survey of 120 stakeholders revealed that sustainability improved by 30.73 points during the period of strict containment. On the other hand, the study showed that some areas are still vulnerable, such as the lack of social security coverage for employees and the weak coordination of stakeholders in CAF & L.; Cet article vise à évaluer la durabilité de la chaîne d’approvisionnement en fruits et légumes (CAF & L) de la ville de Meknès au Maroc dans le contexte de la crise sanitaire du Covid-19. Durant cette crise, de nouvelles pratiques d’achat plus durables ont émergé (l’achat mutualisé et de proximité, la réduction des pertes…) et ont fait ainsi évoluer la CAF & L vers un processus de durabilité. Notre méthode a été basée sur le calcul de la performance de 12 indicateurs composant 5 dimensions de la durabilité (les dimensions territoriale, économique, sociale, écologique et de la sécurité alimentaire). L’enquête menée auprès de 120 acteurs a révélé que la durabilité s’est améliorée de 30,73 points pendant la période de strict confinement. En revanche, l’étude a montré que certains domaines sont encore vulnérables, comme l’absence de la couverture sociale des salariés et la faible coordination des acteurs dans la CAF & L.

Dossier complet ici : https://journals.openedition.org/ced/3340; International audience; This pandemic has both (re)highlighted and accentuated pre-existing inequalities between territories across the planet, reminding us of the unequal distribution of economic, social and educational capital, a thesis defended over half a century ago by Jean-Claude Passeron and Pierre Bourdieu. The COVID-19 pandemic that is currently affecting most of the world's countries is now a long-term phenomenon. Indeed, as long as it is not completely under control (will it be? And in what time frame?), each and every one of us may feel psychological, social and health consequences depending on our personal or professional situation. As the third school and university year marked by the pandemic begins in some countries or territories, this issue 19 of the journal Contexts and Didactics takes the challenge of taking a different time frame from that of the pandemic. It thus proposes to welcome contributions that are certainly part of the continuation of the analyses on pedagogical continuity already begun, but that investigate the consequences of the pandemic in the longer term and this in diverse cultural and institutional contexts, and that can be done in a lessons learned dimension, for some, but also with a view to considering the future of education and training.; Cette pandémie a tant (re)mis en lumière qu’accentué les inégalités préexistantes entre territoires d’un bout à l’autre de la planète nous rappelant l’inégale répartition du capital à la fois économique, social et scolaire, une thèse défendue il y a plus d’un demi-siècle par Jean-Claude Passeron et Pierre Bourdieu. La pandémie de COVID-19 qui frappe actuellement la majeure partie des pays du monde s’inscrit désormais dans un temps long. En effet, tant qu’elle ne sera pas complètement maîtrisée (le sera-t-telle ? Et dans quelle temporalité ?), chacun et chacune pourra ressentir des conséquences psychologiques, sociales et de santé en fonction de sa situation personnelle ou professionnelle. Alors que commence, dans certains pays ou territoires, la troisième année scolaire et universitaire marquée par la pandémie, ce numéro 19 de la revue Contextes et Didactiquesfait le pari de s’inscrire dans une temporalité autre que celle de la pandémie. Il se propose ainsi d’accueillir des contributions qui s’inscrivent certes dans la poursuite des analyses sur la continuité pédagogique déjà entamées mais investiguant les conséquences de la pandémie à plus long terme et ceci dans des contextes culturels et institutionnels divers et qui peut se faire dans une dimension de lessons learned, pour certains, mais aussi en vue d’envisager le futur de l’éducation et de la formation.

Contexte : Les injustices épistémiques sont de plus en plus décriées dans le domaine de la santé mondiale. Cette étude vise à déterminer si la source des connaissances influence la perception de ces connaissances et la volonté de les utiliser. Méthodes : L’étude suit un devis expérimental randomisé dans lequel les participant·es ont été assigné·es au hasard à l'une des sept notes de politique conçues avec le même contenu scientifique, mais avec différentes organisations présentées comme autrices. Chaque organisation était représentative d'une autorité financière, scientifique ou morale. Pour chaque type d'autorité, deux organisations étaient proposées : l'une nord-américaine ou européenne, l'autre africaine. Résultats : Les résultats montrent que le type d’autorité et la localisation des organisations autrices ne sont pas significativement associés à la qualité perçue et à l’utilisation instrumentale déclarée. Toutefois, des interactions entre le type d’autorité et la localisation étaient significatives. Ainsi, les analyses stratifiées ont mis en évidence que pour la qualité perçue, les notes de politique signées par l'organisme bailleur (autorité financière) africain obtenaient de meilleurs scores que les notes de politique signées par l’organisme bailleur nord-américain/européen. Tant pour la qualité perçue que pour l'utilisation instrumentale déclarée, ces analyses stratifiées ont révélé que les notes de politique signées par l'université africaine (autorité scientifique) étaient associées à des scores plus faibles que les notes de politique signées par l'université nord-américaine/européenne. Interprétation : Les résultats confirment l'influence significative des sources sur la perception des connaissances en santé mondiale et rappellent l’intersectionnalité de l’influence des sources d’autorité. Cette analyse nous permet à la fois d'en apprendre davantage sur les organisations qui dominent la scène de la gouvernance mondiale en santé et de réfléchir aux implications pour les pratiques d'application des connaissances. Cet article est republié en français avec l’autorisation de la maison d’édition Springer. Revue francophone de recherche sur le transfert et l’utilisation des connaissances , Vol. 6 No 3 (2022): Volume 6 - Numéro 3

International audience; Dans cet article, nous rappelons la façon dont les données sur la mortalité et sur les causes de décès sont rassemblées et analysées en temps normal en France. Nous détaillons ensuite comment les organismes compétents (Insee, Inserm) ont mis en place des mesures exceptionnelles pour produire plus rapidement des statistiques sur la mortalité et les contaminations pendant l’épidémie de la COVID-19. Ces statistiques sont reprises par les médias et utilisées par les pouvoirs publics et le monde politique. Nous appelons à beaucoup de prudence quant à l’interprétation et l’utilisation de ces données dont le traitement est encore en cours.

Travail du groupe de modélisation de l'équipe ETE

RNA-seq technology is the new standard for measuring gene expression. Its variations can be linked to many pathologies or phenotypes and can be detected by statistical methods called differential analysis. The purpose of differential analysis is to identify genes whose expression is significantly associated with a set of variables. The increasing complexity of experimental designs requires more flexible approaches, in terms of the nature of the variables to be tested and the covariates to take into account, while controlling the false discovery rate. We introduce a new differential analysis method for bulk RNA-seq data based on a linear mixed effects model and a variance component score test. Through a simulation study and the analysis of a real-world Tuberculosis data set, it is shown that our method retains good statistical power and limits the number of potential false positives, compared to the most popular methods. While bulk RNA-seq data represent the average expression of a cell population, the recent development of single-cell RNA-seq technology allows to measure gene expression at the cell level, providing a new biological resolution. The specificity of this type of data lies in the large number of zeros and the heterogeneity of the distributions, often multimodal, making modelling difficult. In order to combine flexibility and distribution-free tool, we propose an approach based on a conditional independence test which relies on an original estimation of conditional cumulative distribution functions using multiple regressions. We apply it to a real data set of SARS-CoV-2 reactive CD8+ T cells, in order to identify genes differentially expressed in three COVID-19 severity groups while considering seven different cell subpopulations.; La technologie RNA-seq s’impose comme le nouveau standard pour la mesure de l’expression génique. Ses variations peuvent être mises en lien avec de nombreuses pathologies ou phénotypes et peuvent être détectées par des méthodes statistiques dites d’analyse différentielle. L’objectif de l’analyse différentielle est d’identifier les gènes dont le niveau d’expression est significativement associé à un ensemble de variables. La complexité grandissante des schémas expérimentaux exige des approches plus flexibles, par la nature des variables à tester et par la prise en compte de covariables, tout en maîtrisant le taux de fausses découvertes. Nous introduisons une nouvelle méthode d’analyse différentielle pour données RNA-seq en masse reposant sur un modèle linéaire à effets mixtes et un test du score en composante de variance. Par une étude de simulations et une analyse d’un jeu de données réelles sur la Tuberculose, il apparaît que notre méthode conserve une bonne puissance statistique et limite le nombre de potentiels faux positifs, comparativement aux méthodes les plus populaires. Tandis que les données RNA-seq en masse correspondent à l’expression moyenne d’une population cellulaire, l’émergence récente de la technologie RNA-seq en cellule unique a permis de mesurer le niveau d’expression des gènes à l’échelle de la cellule offrant ainsi une résolution biologique inédite. La particularité de ce nouveau type de données réside dans le nombre important de zéros et l’hétérogénéité des distributions, souvent multimodales, rendant la modélisation difficile. Afin d’allier flexibilité et absence d’hypothèse distributionnelle, nous proposons une approche basée sur un test d’indépendance conditionnelle qui s’appuie sur une estimation originale des fonctions de distribution conditionnelles par des régressions multiples. Nous l’appliquons à un jeu de données réelles de cellules T CD8+ réactives au SARS-CoV-2, afin d’identifier les gènes différentiellement exprimés dans trois groupes de gravité COVID-19 tout en tenant compte de sept sous-populations cellulaires différentes.

National audience; Saisi par voie de référé-liberté par madame Clémentine Autain et « La France insoumise », le Conseil d’État devait trancher la question de la légalité de dispositions fixées par décret encadrant, pour des raisons liées à l’épidémie de Covid 19, la liberté de réunion et de manifestation en période électorale. Par une ordonnance du 11 juin 2021, la Haute juridiction administrative applique en l’espèce des méthodes classiques visant à concilier des normes d’égale valeur constitutionnelle, à contrôler la proportionnalité des mesures de police adoptées et à assurer le respect du principe d’égalité. De manière plus audacieuse, il interprète les dispositions attaquées afin de les « sauver » comme ne limitant pas le nombre de participants possible à une réunion électorale.

Les PME constituent l'épine dorsale de toute économie (Eggers, 2020). Ainsi, lorsque la pandémie COVID-19 a surgi toute l’économie est mise en péril et les PME sont durement touchées. Les premiers chiffres paraissent certes, alarmants, toutefois les perspectives de sortie de ce tourbillon demeurent optimistes. À fin 2020, plus que 95% des PME marocaines ont pu maintenir leur activité (HCP, 2021) dont une bonne partie a fait preuve de résilience et d’agilité et a pu surmonter, relativement, les effets dévastateurs de la crise. Notre recherche vise, alors, à étudier les déterminants clés explicatifs de la réussite des PME marocaines en temps de crise sanitaire et économique COVID-19 en mettant l’accent sur trois principales dimensions: l’environnement, l’entrepreneur et les ressources mobilisées. Pour ce faire, nous avons mené une étude qualitative via des entretiens individuels semi-directifs auprès d’un échantillon de type aléatoire simple composé de 20 entrepreneurs œuvrant dans la région de Rabat-Salé-Kenitra. Les résultats obtenus ont montré que bien que le gouvernement marocain a développé une panoplie de mesures d’appui et de soutien aux PME, la majorité des entrepreneurs considérait que la réussite de leur entreprise est inhérente principalement à des facteurs endogènes liés à leur engagement, leur motivation et aux ressources propres mises à leur disposition et subsidiairement, aux facteurs exogènes liés aux caractéristiques du contexte et aux opportunités offertes par l’environnement où ils opèrent. Mots- clés : PME, réussite, crise, résilience, facteurs. Classification JEL: H 12, P47, F64. Type de l’article : Recherche appliquée SMEs are the backbone of any economy (Eggers, 2020). Thus, when the COVID-19 pandemic emerged, the entire economy was put at risk and SMEs were hit hard. The first figures seem to be alarming, but the prospects for emerging from this vortex remain optimistic. At the end of 2020, more than 95% of Moroccan SMEs have been able to maintain their activity (HCP, 2021), many of which have shown resilience and agility and have been able to overcome the devastating effects of the crisis. Our research aims, then, to study the key determinants explaining the success of Moroccan SMEs in times of health and economic crisis COVID-19 by focusing on three main dimensions: the environment, the entrepreneur and the resources mobilized. To this end, we conducted a qualitative study through individual semi-directive interviews with a simple random sample of 20 entrepreneurs operating in the Rabat-Salé-Kenitra region. The results obtained showed that although the Moroccan government has developed a wide range of support measures for SMEs, the majority of the entrepreneurs considered that the success of their business is mainly due to endogenous factors related to their commitment, their motivation and the resources at their disposal, and secondarily, to exogenous factors related to the characteristics of the context and the opportunities offered by the environment in which they operate. Keywords: SME, success, crisis, resilience, factors. JEL Classification : H 12, P47, F64. Paper type: Empirical research.